در خلال برگزاری جشنواره فناوری نانو، کارگاه تخصصی مختلفی در زمینه های استاندارد فناوری نانو، ثبت اختراع (پتنت) در دفاتر ثبت بین المللی، آموزش کار با دستگاه های مختلف حوزه نانو، تجاري‌سازي طرح‌هاي دانش‌بنيان و... برگزار می گردد که پذیرای حضور علاقمندان بسیاری است. ثبت نام در این کارگاه ها از دو طریق اینترنتی و حضور در محل کارگاه انجام می شود. شرکت در کارگاه ها برای عموم آزاد است. در چهارمین جشنواره فناوری نانو 13 کارگاه آموزشی برگزار گردید.